Mak doet onderzoek naar gendergeschiedenis, voornamelijk aan de hand van case studies. Ze kijkt daarbij onder andere naar sekse, seksualiteit, sekse-identiteiten en hoe identiteit wordt vormgegeven door lichamelijke verschillen. Hoe definiëren we ‘mannelijk’ en ‘vrouwelijk’?

Sinds 1 september 2016 bekleedt ze de leerstoel Politieke Geschiedenis van Gender in Nederland aan de Universiteit van Amsterdam. Deze leerstoel is ingesteld vanuit de Stichting Wilhelmina Drucker Fundatie, die als doel heeft om het erfgoed van de eerste feministische golf te bewaren, bestuderen, en actualiseren.

In de periode hiervoor, van 2005 tot 2016, doceerde Mak gendergeschiedenis aan de Radboud Universiteit in Nijmegen.