Fokkema is tevens voorzitter van de jury die de Nationale Sport Innovatie Prijs (NSIP) uitreikt voor het beste innovatieve idee van het jaar in de top- of breedtesport. De NSIP is een initatief van de stichting Sports and Technology en InnoSportNL ter stimulering van innovatie en creativiteit in de sport.

Van 2002 tot 2010 was hij Rector Magnificus aan de TU Delft. In 1979 promoveerde hij aan deze universiteit in de Technische Wetenschappen.