Als geneesheer-directeur bewaakt Kuipers de kwaliteit van de behandelingen en ziet ze toe op de rechten van patiënten die een tbs-behandeling ondergaan in de Van den Hoeven Kliniek en De Waag, het bijbehorende centrum voor ambulante forensische zorg.

Daarnaast brengt ze als freelance pro Justitia-rapporteur de psychische problematiek van verdachten in strafzaken in kaart. Deze rapportages spelen een belangrijke rol in de advisering aan de rechter om wel of geen tbs op te leggen. Ook is Kuipers lid van het ‘Adviescollege Verloftoetsing tbs’, een onafhankelijk college dat alle verlofaanvragen beoordeelt.

Kuipers geeft regelmatig gastcolleges over forensische psychiatrie en blogt voor Medisch Contact over haar werk als psychiater.

Van 2016 tot en met 2023 werkte ze als forensisch psychiater in het Pieter Baan Centrum, de psychiatrische observatiekliniek waar verdachten van ernstige delicten worden onderzocht door gedragsdeskundigen.