Kootte werkt vooral op de spoedeisende hulp van het UMC Utrecht, als supervisor van de interne geneeskunde en medisch coördinator van de gehele SEH. Daarnaast heeft hij ervaring met het geven van ABCDE-trainingen aan artsen en verpleegkundigen, de methodiek die wordt gebruikt om te bepalen welke aandoening zij als eerste moeten behandelen: "treat first what kills first". 

Hij geeft ook trainingen gericht op het verbeteren van de samenwerking van medische teams in spoedeisende situaties en is bovendien een enthousiaste gebruiker van spoedechografie.